Pored informacionog sistema za osnovnu delatnost – zdravstvo, koja se bavi pacijentima, zdravstvene ustanove koriste i informacione sisteme za praćenje ostatka poslovanja.
Najpre, to je praćenje zaliha materijala i sitnog inventara (ROK, MAT). Zalihe se prate po lotovima i rokovima trajanja, za artikle za koje je ova evidencija obavezna. Upravljanje zalihama olakšava mogućnost definisanja minimalnih i maksimalnih zaliha na osnovu potrošnje iz prethodnog perioda, čime se znatno olakšava proces nabavke putem tendera ili direktno. Pored zaliha, potrebo je pratiti i stanje kod računopolagača.
Iz aplikacija se prate ulazne fakture (FIPO), ugovori (DUGA) i plaćanja dobavljačima (VIR). Veza sa RINOm i podnošenje izveštaja je zakonska obaveza.
Obračun zarada podleže posebnim zahtevima zakonodavca i takođe treba da bude obrađeno kroz informacioni system (OZ).